故事设定在一个从未出现过奥特曼与怪兽的地球上。某天，一名外星人意外从宇宙坠落，他手持有着象征身份的红色宇宙回旋镖“奥美迦头镖”，并有着“究极”的称号。失去过往记忆的外星人 “奥美迦” 化身为地球人模样，被人称为“宙人”。初到地球的宙人，对人类充满好奇，积极主动地接触和了解这些陌生的生命体。当神秘巨型生物接连出现时，尘封的记忆碎片被唤醒，宙人认出这些生物正是记忆中的 “怪兽”。面对怪兽的威胁，强烈的使命感驱使他变身成为奥美迦奥特曼，与怪兽展开战斗。
本作作为系列第5季、开播15周年的作品，以“信息犯罪特命对策室”（简称：DICT）为舞台。DICT是一个追查利用高度信息技术、威胁国民生命与财产的信息犯罪的调查机构，其中最年长的刑警二宫奈美（泽口靖子 饰）曾多年在所辖警署工作，40岁时接受刑警培训，之后在生活安全科负责处理青少年犯罪等事务。她的搜查风格，是充分发挥生活安全科经验的“扎根社区型”。一贯秉持着“直面每一个人”的信条，始终帮助眼前有困难的人。如今，这样的二宫将要面对的是“看不见面孔的敌人”——信息犯罪。
