在风之街“风都”，左翔太郎、拍档菲利普以及所长鸣海亚树子三人经营着侦探事务所。看似一片和平的风都背后，神秘组织在地下流通着能让普通人变成Dopant的“恶之盖亚存储条”。而造成众多离奇事件的神秘组织核心“园咲家”的每个人，都在风都有着很大的影响力。挑战Dopant们引发离奇事件的翔太郎和菲利普两人，使用六根“盖亚存储条”合体变身成假面骑士W，决然地对抗着园咲家族。园咲家族的目的到底是什么？假面骑士W、菲利普神秘的过去又是什么？隐含着众多谜题，假面骑士W的战斗拉开帷幕……
本作作为系列第5季、开播15周年的作品，以“信息犯罪特命对策室”（简称：DICT）为舞台。DICT是一个追查利用高度信息技术、威胁国民生命与财产的信息犯罪的调查机构，其中最年长的刑警二宫奈美（泽口靖子 饰）曾多年在所辖警署工作，40岁时接受刑警培训，之后在生活安全科负责处理青少年犯罪等事务。她的搜查风格，是充分发挥生活安全科经验的“扎根社区型”。一贯秉持着“直面每一个人”的信条，始终帮助眼前有困难的人。如今，这样的二宫将要面对的是“看不见面孔的敌人”——信息犯罪。
